Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rpap1Q80TE0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpap1Q80TE0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap1Q80TE0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms