Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf7ipQ7TT18 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms