Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lamp3Q7TST5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms