Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2q1Q7TSS2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms