Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmQ7TSN2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms