Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf516Q7TSH3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf516Q7TSH3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms