Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dsg1cQ7TSF0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms