Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RgmbQ7TQ33 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RgmbQ7TQ33 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms