Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim17Q7TPM3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim17Q7TPM3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms