Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmed3Q78IS1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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