Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd3eapQ76KJ5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms