Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rpl35Q6ZWV7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms