Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SpopQ6ZWS8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SpopQ6ZWS8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms