Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms