Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcl3Q6W5C0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms