Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ift172Q6VH22 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ift172Q6VH22 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms