Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc88cQ6VGS5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms