Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Timd4Q6U7R4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms