Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GcsamQ6RFH4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms