Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab35Q6PHN9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab35Q6PHN9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms