Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc57Q6PHN1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms