Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc82Q6PG04 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms