Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms