Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms