Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms