Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkab2Q6PAM0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkab2Q6PAM0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms