Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2mQ6P6I6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2mQ6P6I6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms