Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gga2Q6P5E6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga2Q6P5E6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms