Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam222bQ6P539 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam222bQ6P539 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms