Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac10Q6P3E7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac10Q6P3E7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms