Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxip1Q6NZQ4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxip1Q6NZQ4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms