Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI8

Cxxc4, CXXC-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc4Q6NXI8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxxc4Q6NXI8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms