Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rprd2Q6NXI6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rprd2Q6NXI6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms