Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ltv1Q6NSQ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltv1Q6NSQ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms