Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn11Q6J756 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms