Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms