Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Krt40Q6IFX3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt40Q6IFX3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt40Q6IFX3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt40Q6IFX3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt40Q6IFX3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt40Q6IFX3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt40Q6IFX3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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