Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm5416Q6IE28 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm5416Q6IE28 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Gm5416Q6IE28 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Gm5416Q6IE28 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Gm5416Q6IE28 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gm5416Q6IE28 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5416Q6IE28 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gm5416Q6IE28 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm5416Q6IE28 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm5416Q6IE28 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm5416Q6IE28 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5416Q6IE28 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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