Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nckap5lQ6GQX2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nckap5lQ6GQX2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms