Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rftn1Q6A0D4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms