Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Cep290Q6A078 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Cep290Q6A078 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Cep290Q6A078 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep290Q6A078 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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