Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc5lQ6A068 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc5lQ6A068 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc5lQ6A068 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc5lQ6A068 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdc5lQ6A068 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdc5lQ6A068 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdc5lQ6A068 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdc5lQ6A068 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc5lQ6A068 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc5lQ6A068 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc5lQ6A068 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc5lQ6A068 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc5lQ6A068 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc5lQ6A068 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdc5lQ6A068 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms