Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sv2cQ69ZS6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms