Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrcc1Q69ZB0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrcc1Q69ZB0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrcc1Q69ZB0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrcc1Q69ZB0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrcc1Q69ZB0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrcc1Q69ZB0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrcc1Q69ZB0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrcc1Q69ZB0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrcc1Q69ZB0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrcc1Q69ZB0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms