Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp4Q68FH0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp4Q68FH0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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