Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg9aQ68FE2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg9aQ68FE2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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