Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Papd5Q68ED3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Papd5Q68ED3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms