Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CilpQ66K08 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms