Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2bQ64511 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Top2bQ64511 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms