Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc18Q640L5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc18Q640L5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc18Q640L5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms